Si intentas copiar datos en una escena y las localizaciones se muestran con la ruta absoluta, asegúrate de que el archivo de escena se ha creado correctamente.

Este error suele ocurrir cuando mueves a mano los directorios de escenas después de haberse creado con el Project Manager. Es muy común si utilizas una estructura de carpetas personalizada. Como un paquete independiente para archivos de escenas o algo así.

De todas formas, símlemente carga el archivo de escenas en el editor y corrige o elimina la línea $EDITOR_PROJECT_ROOT_DIR$. Estará apuntando a la dirección errónea.

Espero que te haya ayudado.